生物有效剂量指经吸收、代谢活化、转运、最终达到器官、组织、细胞、亚细胞或分子等靶部位或替代性靶部位的污染物量。如致癌物或其活化的产物与DNA或血红蛋白形成的加合物的含量。生物有效剂量直接与产生的有害效应相关。不过在检测方法和样品采集上有更多的困难。

人乳中污染物的浓度既反映了母亲内暴露水平，又反映了婴儿外暴露水平。

化学性质稳定、易蓄积于某些组织（如脂肪、毛发）的化学污染物的相应生物材料的监测，能说明这些污染物的“体内负荷”，同时也能代表人体暴露的水平。