人类尿道上皮尤其是柱状上皮细胞对淋球菌相当敏感。在感染淋球菌后，经过一段时间的潜伏期（平均3天-5天）。由于细菌和毒素的作用，粘膜坏死、脱落、神经末梢暴露、炎症浸润、组织液渗出，病人会出现尿急、尿痛和尿道流脓等急性尿道炎症状。

淋球菌感染男性病人，常会出现尿痛和尿道流脓等临床症状。这时取尿道分泌物作涂片，经革兰染色后，如见到有符合淋球菌形态特征的革兰阴性细胞内双球菌，则初步诊断阳性，可对病人进行治疗；如涂片查菌阴性，应从尿道取标本进行淋球菌培养。淋球菌感染的女病人，常仅有脓性宫颈分泌物或无症状。对女病人不推荐用涂片法检查，而主张直接从宫颈取材进行培养。标本经培养后，菌落形态典型、氧化酶试验阳性，菌体为革兰阴性双球菌，则初步诊断为阳性培养物，如有某些性状不符合，则可进一步用糖发酵试验及直接免疫荧光法等作鉴定加以确诊。