1.早期采集：最好在病程早期、急性期或症状典型时，且必须在使用抗生素前。

2.无菌采集：采集标本应无外源污染。在采集血液、脑脊液、胸腔积液、关节液等无菌标本时，应严格进行无菌操作。对于与外界相同的腔道，如窦道标本应由窦道底部区活组织检查，而不应从窦道口取标本，以免受皮肤表面正常菌群的污染，造成混淆和误诊;对于从正常菌群寄生部位采集标本，应明确检查的目的菌，在进行分离培养时，采集特殊选择性培养基。采集的标本均应盛于无菌容器内，而不能用消毒剂或酸类处理。

3.根据目的菌的特性用不同的方法采集：厌氧菌、需氧或兼性厌氧菌，以及L型菌采集的方法不同。

4.采集适量标本：采集量不应过少，而且要有代表性，同时有些标本还要注意在不同时间、不同病程，采集不同部位标本。

5.安全采集：采集标本时不仅要防止皮肤和粘膜正常菌群对标本的污染，同时也要注意安全，防止传播和自身感染。

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