免疫球蛋白具有抗原性，可用以免疫动物制备相应的抗体，而这种抗体常用于免疫球蛋白的检测。五类免疫球蛋白皆可用前面介绍的纯化方法提取出来。如将这些免疫球蛋白分解成片段，如Fc段、Fab段、轻链等作为免疫原制备抗血清，则可制得分辨能力更高的特异性抗体。制备方法如下：

1.温和条件析离亚单位亚单位之间以非共价键、如氢键、静电引力等连接起来，这些键结合力较弱，可经2种方法将其断开制备片段。第一种方法是改变pH，一般将pH调至3～4（羧基滴定范围）和9～10（赖氨酸－酪氨酸滴定范围），当低于3或高于10时，亚单位会离解。这个方法是利用强变性剂，如8mol/L盐酸胍等。用此可以将亚单位分开。这个方法也用于载脂蛋白抗原的解离和胶原肽的提取。

2.二硫键的解离二硫键是连接Ig肽链的共价键，解离二硫键可将轻链与重链分开。解离的方法多采用氧化法和还原法。氧化法的优点是切开后，肽链不能重新形成二硫键，便于肽链纯化；缺点是甲硫氨酸被氧化成亚砜，色氨酸侧链被破坏。还原法是将二硫键还原成巯基。但这个疏基极不稳定，易再重新结合成二硫键，必须及时用碘乙酸或碘代乙酰胺进行羧甲基化。

3.溴化氰裂解法溴化氰与蛋白质中的甲硫氨酸侧链的硫醚基起反应，生成溴化亚氨内酯。此产物与水反应，将肽链断裂。

4.酶裂解法因为酶解有极好的专一性，不同的片段可用不同的酶裂解。如木瓜酶可将IgG裂解成Fc和Fab（×2）3个片段，胃蛋白酶可将IgG解成F（ab＇）2和几个小肽段，胰蛋白酶则将其切成不规则的肽链。作为抗原制备常用木瓜酶切断，取得Fc段，以制备抗链血清。作为抗体试剂应用，常用胃蛋白酶切断取得F（ab＇）2。